Президент Общероссийской общественной организации "Ассоциация колопроктологов России", ФГБУ «НМИЦ колопроктологии имени А.Н. Рыжих» Минздрава России, Научный руководитель ФГБУ «НМИЦ колопроктологии имени А.Н.Рыжих» Минздрава России, главный внештатный специалист-колопроктолог Министерства здравоохранения Российской Федерации, главный внештатный специалист – колопроктолог Департамента здравоохранения города Москвы, Заслуженный врач Российской Федерации, доктор медицинских наук, профессор, академик РАН.

С 1974г. по 1976 г. проходил обучение в клинической ординатуре на курсе проктологии Центрального Ордена Ленина института усовершенствования врачей МЗ СССР (ФГБОУ ДПО «РМАНПО» Минздрава России).

В 1982 г. Ю.А. Шелыгин защитил кандидатскую диссертацию.

С 2011 по 2021 год Юрий Анатольевич Шелыгин - директор ФГБУ "НМИЦ колопроктологии имени А.Н.Рыжих" Минздрава России.

Ю.А. Шелыгин автор и соавтор более 450 печатных работ, имеет более 20 патентов на изобретения. Инновационные разработки, сделанные под его руководством и непосредственным участием, получили высокую оценку руководства страны: в 2003 году за разработку современной стратегии хирургической реабилитации больных раком прямой кишки и в 2016 году Юрий Анатольевич был награжден Премией Правительства Российской Федерации в области науки и техники за разработку и внедрение междисциплинарной стратегии в лечении колоректального рака. В 2016 году Ю.А. Шелыгин избран член-корреспондентом, а в 2019 году – академиком Российской Академии наук.

Под руководством академика Ю.А. Шелыгина защищено 9 докторских и 22 кандидатских диссертации. В 2011 году избран заведующим кафедрой колопроктологии ФГБОУ ДПО «РМАНПО» Минздрава России. Академик Ю.А. Шелыгин является главным редактором журнала «Колопроктология», членом редколлегии и редакционных советов российских журналов «Онкохирургия», «Онкопроктология», «Хирургия. Журнал имени Н.И. Пирогова», «Анналы хирургии», «Вестник хирургии им. И.И. Грекова» и т.д.

С 2011 года по 2016 год являлся членом правления Европейской Ассоциации колопроктологов (ESCP) (в 2014-2015 гг. был ее Президентом). С 2011 года Ю.А. Шелыгин является президентом общероссийской общественной организации «Ассоциация колопроктологов России», членом правления Ассоциации онкологов России, Российской ассоциации эндоскопических хирургов.

Лауреат Премии Правительства Российской Федерации в области науки и техники 2003г. и 2016г.