gnckКолопроктологияKoloproktologia2073-75562686-7303Russian Association of Coloproctology10.33878/2073-7556-2022-21-2-58-63gnck-1695Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИORIGINAL ARTICLESМолекулярно-генетическое профилирование пациентов с аденоматозными полипами желудочно-кишечного трактаMolecular-genetic profiling of patients with adenomatous polyps of the gastrointestinal tracthttps://orcid.org/0000-0002-6212-7627ЛисицаТ. С.LisitsaT. S.

Татьяна Сергеевна Лисица

ФГБУ «ЦСП» 

119121

ул. Погодинская, д. 10с1

Электронный адрес: polikarpova-e@yandex.ru

Москва

Tatiana S. Lisitsa

Federal State Budgetary Institution “Centre for Strategic Planning and Management of Biomedical Health Risks”

119121

Pogodinskaya street, 10 bld. 1

Moscow

TLisitsa@cspmz.ruhttps://orcid.org/0000-0002-3573-8342ДанишевичА. М.DanishevichA. M.

ГБУЗ МКНЦ имени А. С. Логинова 

111123

ш. Энтузиастов, д. 86

Москва

Anastasia M. Danishevich

State budgetary healthcare institution “Тhe Loginov Moscow Clinical Scientific Center"

111123

Shosse Entuziastov, 86

Moscow

https://orcid.org/0000-0002-0723-9765ХахинаА. О.KhakhinaA. O.

ФГБУ «ЦСП» 

119121

ул. Погодинская, д. 10с1

Москва

Anastasia O. Khakhina

Federal State Budgetary Institution “Centre for Strategic Planning and Management of Biomedical Health Risks”

119121

Pogodinskaya street, 10 bld. 1

Moscow

https://orcid.org/0000-0003-0485-7450ИбрагимоваА. Ш.IbragimovaA. S.

ФГБУ «ЦСП» 

119121

ул. Погодинская, д. 10с1

Москва

Amina S. Ibragimova

Federal State Budgetary Institution “Centre for Strategic Planning and Management of Biomedical Health Risks”

119121

Pogodinskaya street, 10 bld. 1

Moscow

https://orcid.org/0000-0002-0673-4908ШагинаА. Д.ShaginaA. D.

ФГБУ «ЦСП» 

119121

ул. Погодинская, д. 10с1

Москва

Anastasia D. Shagina

Federal State Budgetary Institution “Centre for Strategic Planning and Management of Biomedical Health Risks”

119121

Pogodinskaya street, 10 bld. 1

Moscow

https://orcid.org/0000-0002-6228-5756ВалееваА. Е.ValeevaA. E.

ГБУЗ МКНЦ имени А. С. Логинова 

111123

ш. Энтузиастов, д. 86

Alexandra E. Valeeva

State budgetary healthcare institution “Тhe Loginov Moscow Clinical Scientific Center"

111123

Shosse Entuziastov, 86

Moscow

https://orcid.org/0000-0002-3119-7673БодуноваН. А.BodunovaN. A.

ГБУЗ МКНЦ имени А. С. Логинова 

111123

ш. Энтузиастов, д. 86

Natalya A. Bodunova

State budgetary healthcare institution “Тhe Loginov Moscow Clinical Scientific Center"

111123

Shosse Entuziastov, 86

Moscow

https://orcid.org/0000-0002-6954-1564АбрамовИ. С.AbramovI. S.

ФГБУ «ЦСП» 

119121

ул. Погодинская, д. 10с1

Москва

Ivan S. Abramov

Federal State Budgetary Institution “Centre for Strategic Planning and Management of Biomedical Health Risks”

119121

Pogodinskaya street, 10 bld. 1

Moscow

https://orcid.org/0000-0002-3668-6601ШипулинГ. А.ShipulinG. A.

ФГБУ «ЦСП» 

119121

ул. Погодинская, д. 10с1

Москва

German A. Shipulin

Federal State Budgetary Institution “Centre for Strategic Planning and Management of Biomedical Health Risks”

Moscow

ФМБА РоссииРоссияFederal Medical Biological AgencyRussian FederationДЗМРоссияHealth department of MoscowRussian Federation2022210620222125863Copyright © Лисица Т.С., Данишевич А.М., Хахина А.О., Ибрагимова А.Ш., Шагина А.Д., Валеева А.Е., Бодунова Н.А., Абрамов И.С., Шипулин Г.А., 20222022Лисица Т.С., Данишевич А.М., Хахина А.О., Ибрагимова А.Ш., Шагина А.Д., Валеева А.Е., Бодунова Н.А., Абрамов И.С., Шипулин Г.А.Lisitsa T.S., Danishevich A.M., Khakhina A.O., Ibragimova A.S., Shagina A.D., Valeeva A.E., Bodunova N.A., Abramov I.S., Shipulin G.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://www.ruproctology.com/jour/article/view/1695

   Цель: поиск наследственных мутаций у пациентов с аденоматозными полипами желудочно-кишечного тракта.   Пациенты и методы: ретроспективое когортное исследование были включены 8 пациентов с аденоматозными полипами желудочно-кишечного тракта (от 4 до нескольких сотен). Были исследованы гены APC, AXIN2, BMPR1A, BRCA2, CDH1, CHEK2, EPCAM, GALNT12, GREM1, MLH1, MLH3, MSH2, MSH3, MSH6, MutYH, NTHL1, PMS2, POLD1, POLE, SMAD4, STK11 методом высокопроизводительного секвенирования.   Результаты: у 5 пациентов были обнаружены патогенные мутации в генах APC (3 пациента с количеством полипов > 100), POLE (1 пациент с количеством полипов < 10), MutYH (1 пациент — с 2 мутациями при количестве полипов > 28; 1 пациент с моноаллельной мутацией в сочетании с мутацией в гене АРС при количестве полипов > 100).   Заключение: вероятность обнаружения патогенной мутации возрастает с увеличением количества полипов у пациента.

   Aim

   Aim: to reveal hereditary mutations in patients with adenomatous polyps of the gastrointestinal tract.   Patients and methods: a retrospective cohort study included 8 patients with adenomatous polyps of the gastrointestinal tract (ranging from 4 to several hundred). The APC, AXIN2, BMPR1A, BRCA2, CDH1, CHEK2, EPCAM, GALNT12, GREM1, MLH1, MLH3, MSH2, MSH3, MSH6, MutYH, NTHL1, PMS2, POLD1, POLE, SMAD4, STK11 genes were studied using new generation sequencing.   Results: five patients were found to have pathogenic mutations in the genes APC (3 patients with > 100 polyps), POLE (1 patient with < 10 polyps), MutYH (1 patient with 2 mutations with > 28 polyps; 1 patient with monoallelic mutation in combination with a mutation in the APC gene with a number of polyps > 100).

   Conclusion

   Conclusion: the probability of detecting a pathogenic mutation increases with an increase in the number of polyps in a patient.

аденоматозные полипыполипы желудкаполипы толстой кишкисемейный аденоматозный полипозNGSтаргетное секвенированиеadenomatous polypsstomach polypscolon polypsfamilial adenomatous polyposisNGStargeted sequencingИсследование выполнено в рамках государственного задания №№ 388-00102-20-01/ 388-00154-21-00.The study was carried out within the framework of the state task No. 388-00102-20-01/ 388-00154-21-00.ReferencesHuang Y., Gong W., Su B., et al. Recurrence and surveillance of colorectal adenoma after polypectomy in a southern Chinese population. J Gastroenterol. 2010; 45: 838–45. DOI: 10.1007/s00535-010-0227-3Huang Y., Gong W., Su B., et al. Recurrence and surveillance of colorectal adenoma after polypectomy in a southern Chinese population. J Gastroenterol. 2010; 45: 838–45. DOI: 10.1007/s00535-010-0227-3Hao Y., Wang Y., Qi M., et al. Risk Factors for Recurrent Colorectal Polyps. Gut Liver. 2020; 14: 399–411. DOI: 10.5009/gnl19097Hao Y., Wang Y., Qi M., et al. Risk Factors for Recurrent Colorectal Polyps. Gut Liver. 2020; 14: 399–411. DOI: 10.5009/gnl19097Скрининг колоректального рака. Практическое руководство Всемирного гастроэнтерологического общества (ВГО) и Международного союза по профилактике рака пищеварительной системы. WGO. 2008.Colorectal cancer screening. Practical guide of the World Gastroenterological Society (WGO) and the International Union for the Prevention of Cancer of the Digestive System. WGO. 2008. (in Russ.).Brosens L. A. A., Wood L. D., Offerhaus G. J., et al. Pathology and Genetics of Syndromic Gastric Polyps. Int J Surg Pathol. 2016; 24: 185–99. DOI: 10.1177/1066896915620013Brosens L. A. A., Wood L. D., Offerhaus G. J., et al. Pathology and Genetics of Syndromic Gastric Polyps. Int J Surg Pathol. 2016; 24: 185–99. DOI: 10.1177/1066896915620013Half E., Bercovich D., Rozen P. Familial adenomatous polyposis. Orphanet J Rare Dis. 2009; 4: 22. DOI: 10.1186/1750-1172-4-22Half E., Bercovich D., Rozen P. Familial adenomatous polyposis. Orphanet J Rare Dis. 2009; 4: 22. DOI: 10.1186/1750-1172-4-22Powell S. M., Zilz N., Beazer-Barclay Y., et al. APC mutations occur early during colorectal tumorigenesis. Nature. 1992; 359: 235–7. DOI: 10.1038/359235a0Powell S. M., Zilz N., Beazer-Barclay Y., et al. APC mutations occur early during colorectal tumorigenesis. Nature. 1992; 359: 235–7. DOI: 10.1038/359235a0Цуканов А. С. Дифференциальный диагноз MutYH-ассоциированного полипоза и спорадических полипов толстой кишки / А. С. Цуканов [и др.] // Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии. – 2018. – 28 (6): 51–57. DOI: 10.22416/1382-4376-2018-28-6-51-57Tsukanov A. S., Shubin V. P., Kuzminov A. M. et al. Differential diagnosis of MutYH-associated polyposis and sporadic colon polyps. Russian Journal of Gastroenterology, Hepatology, Coloproctology. 2018; 28 (6): 51–57. (In Russ.). DOI: 10.22416/1382-4376-2018-28-6-51-57Knudsen A. L., Bisgaard M. L., Bülow S. Attenuated familial adenomatous polyposis (AFAP). A review of the literature. Fam Cancer. 2003; 2: 43–55. DOI: 10.1023/a:1023286520725Knudsen A. L., Bisgaard M. L., Bülow S. Attenuated familial adenomatous polyposis (AFAP). A review of the literature. Fam Cancer. 2003; 2: 43–55. DOI: 10.1023/a:1023286520725Цуканов А. С. Стратегия комплексного молекулярно-генетического изучения наследственных форм колоректального рака у российских пациентов: автореф. … д-ра. мед. наук / А. С. Цуканов. – Москва, 2017. – 48 с.Tsukanov A. S. Strategy of complex molecular genetic study of hereditary forms of colorectal cancer in Russian patients (abstract. … doctor of medical sciences). Moscow. 2017; 48 р. (In Russ.).Тобоева М. К. MutYH-ассоциированный полипоз толстой кишки / М. К. Тобоева [и др.] // Терапевтический архив. – 2019. – 91 (2): 97–100. DOI: 10.26442/00403660.2019.02.000124Toboeva M. K., Shelygin Yu. A., Frolov S. A., et al. MutYH-associated polyposis. Ter Arkh. 2019;91(2):97–100. (in Russ.). DOI: 10.26442/00403660.2019.02.000124Nielsen M., Infante E., Brand R. MutYH Polyposis. In: Adam M. P., Ardinger H. H., Pagon R. A., et al. GeneReviews®. Seattle (WA): University of Washington, Seattle 1993. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK107219/ (accessed 25 Jan 2022).Nielsen M., Infante E., Brand R. MutYH Polyposis. In: Adam M. P., Ardinger H. H., Pagon R. A., et al. GeneReviews®. Seattle (WA): University of Washington, Seattle 1993. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK107219/ (accessed 25 Jan 2022).Testa U., Pelosi E., Castelli G. Colorectal cancer: genetic abnormalities, tumor progression, tumor heterogeneity, clonal evolution and tumor-initiating cells. Med Sci (Basel). 2018; 6: E31. DOI: 10.3390/medsci6020031Testa U., Pelosi E., Castelli G. Colorectal cancer: genetic abnormalities, tumor progression, tumor heterogeneity, clonal evolution and tumor-initiating cells. Med Sci (Basel). 2018; 6: E31. DOI: 10.3390/medsci6020031Weren R. D., Ligtenberg M. J., Geurts van Kessel A., et al. NTHL1 and MutYH polyposis syndromes: two sides of the same coin? J Pathol. 2018; 244: 135–42. DOI: 10.1002/path.5002Weren R. D., Ligtenberg M. J., Geurts van Kessel A., et al. NTHL1 and MutYH polyposis syndromes: two sides of the same coin? J Pathol. 2018; 244: 135–42. DOI: 10.1002/path.5002Adam R., Spier I., Zhao B., et al. Exome Sequencing Identifies Biallelic MSH3 Germline Mutations as a Recessive Subtype of Colorectal Adenomatous Polyposis. Am J Hum Genet. 2016; 99: 337–51. DOI: 10.1016/j.ajhg.2016.06.015Adam R., Spier I., Zhao B., et al. Exome Sequencing Identifies Biallelic MSH3 Germline Mutations as a Recessive Subtype of Colorectal Adenomatous Polyposis. Am J Hum Genet. 2016; 99: 337–51. DOI: 10.1016/j.ajhg.2016.06.015Абрамов И. С. Диагностика наследственных опухолевых синдромов методом высокопроизводительного секвенирования. Опыт создания базы данных / И. С. Абрамов [и др.] // Практическая медицина. –2021. – 12 (3): 36–42. (in Russ.). DOI: 10.17816/clinpract76383Abramov I. S., Lisitsa T. S., Stroganova A. M., et al. Diagnostics of hereditary cancer syndromes by ngs. A database creation experience. Journal of Clinical Practice. 2021;12(3):36–42. (in Russ.). DOI: 10.17816/clinpract76383Richards S., Aziz N., Bale S., et al. Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants: a joint consensus recommendation of the American College of Medical Genetics and Genomics and the Association for Molecular Pathology. Genet Med. 2015; 17: 405–24. DOI: 10.1038/gim.2015.30Richards S., Aziz N., Bale S., et al. Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants: a joint consensus recommendation of the American College of Medical Genetics and Genomics and the Association for Molecular Pathology. Genet Med. 2015; 17: 405–24. DOI: 10.1038/gim.2015.30Bellido F., Pineda M., Aiza G., et al. POLE and POLD1 mutations in 529 kindred with familial colorectal cancer and/or polyposis: review of reported cases and recommendations for genetic testing and surveillance. Genet Med. 2016;18(4):325–32. DOI: 10.1038/gim.2015.7517 Bellido F., Pineda M., Aiza G., et al. POLE and POLD1 mutations in 529 kindred with familial colorectal cancer and/or polyposis: review of reported cases and recommendations for genetic testing and surveillance. Genet Med. 2016;18(4):325–32. DOI: 10.1038/gim.2015.75

The authors declare that there are no conflicts of interest present.